Новым сертификатом ЭП подписывать отправку отчетов в 1С-Отчетность можно только после регистрации нового сертификата в сервисе. Для этого устанавливаем сертификат на компе, переходим:
Отчетность, справки — 1С-Отчетность
Настройки — Заявление на подключение к 1С-Отчетности
Заполняем галки как на скриншоте. Место хранения — На этом компьютере — выбираем новый сертификат, подписываем и отправляем заявление.

После этого ОБЯЗАТЕЛЬНО связываемся с организацией франчайзи 1С, который нас курирует, и просим перенаправить заявление. Можно по телефону, можно письмом.
2025-08-22 после смены сертификата сотрудника перестало отправляться ЕФС-1 с сообщением о том, что отсутствует направление ФСС и предложением отправить заявление. Заявление отправлял дважды с привлечением франчайзи. Безрезультатно.
Техподдержка Калуга Астрал предложила такое решение — они включают что-то вручную на своей стороне, а через 15 минут после звонка админу надо войти в 1С-Отчетность — Настройки — Настройки обмена с контролирующими органами — Расширенные настройки — Настройки обмена с ФНСб Росстатом и СФР (бывш ПФР). Справа от идентификатора нажать кнопку открытия карточки настроек

В карточке настроек нажать «Настроить автоматически сейчас».