В старые добрые времена для этого использовал VirtualDub, но только для файлов AVI.
Потом купил себе лицензию Movavi Video Editor и все вопросы решал с её помощью.
И вот настала необходимость выполнить обрезание на другом компьютере.
Чудесную программу AviDemux помогла найти статья https://www.sankt-video.ru/blog/videograf/kak-i-chem-obrezat-bez-perekodirovaniya-mp4-fajly-s-kodekom. В ней же и ссылка на программу http://www.videohelp.com/tools/AviDemux.
Для обрезания mp4 без перекодирования надо установить границы фрагмента и установить параметры:
«Видео на выходе» — Copy
«Аудио на выходе» — Copy
«Выходной формат» — MP4 Muxer для mp4
Далее Файл — Сохранить. Задаем новое имя файла.